pcr引物退火温度55度时不行,58度可以,为什么在做PCR时,引物用55度的退火温度扩不出来,而用58度却扩出来了,为什么

来源:学生作业帮助网 编辑:作业帮 时间:2024/04/29 11:11:22
pcr引物退火温度55度时不行,58度可以,为什么在做PCR时,引物用55度的退火温度扩不出来,而用58度却扩出来了,为什么

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pcr引物退火温度55度时不行,58度可以,为什么
在做PCR时,引物用55度的退火温度扩不出来,而用58度却扩出来了,为什么

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理论上退火温度越低越利于引物和模板结合,但是有时候就是这样的,低的退火做不出来,高的做出来,我也碰到过这样的情况.其实影响PCR扩增的因素远比我们知道的多得多.我的猜测是这样的,可能刚好在这段引物或者模板上有一段容易形成发夹的序列,退火温度低的情况下,就更容易形成发夹,因而扩不出来,退火温度高的时候引物或者模板上的发夹结构被破坏,引物和模板能正常配对,所以可以扩增出来

引物单子上的温度基础上再加3度,屡试不爽。

对 我的经验也是 好几次都是高退火温度做出来的 同意一楼的观点

55度的时候有没有primer dimer?温度低的时候PCR的特异性会降低,如果看到更多的primer dimer,说明可能55度的时候primer dimer的扩增更加有效率,跟你的DNA template的扩增竞争

pcr引物退火温度55度时不行,58度可以,为什么在做PCR时,引物用55度的退火温度扩不出来,而用58度却扩出来了,为什么 RT-PCR,自己前后引物Tm差7度,前引物63度,后引物58度,退火温度如何设置? 设计引物的时候上下游引物的退火温度分别是56.9和56摄氏度,PCR时退火温度应选多少度!文献上62摄氏度,我感觉有点不对劲啊!给出PCR退火温度的计算的方法!谢谢·· 为什么做PCR设定引物退火温度时设定的退火温度要比合成引物得到的引物Tm值低几度? 退火温度递减的PCR程序叫什么比如PCR退火温度是55 然后每个循环退火温度降低1度 在引物设计时,长度超过25bp时,其PCR退火温度怎么确定? 退火温度低会对PCR产生什么影响?我做菌落PCR,使用一个特异性上游引物和一个T7下游通用引物,退火温度用的是较低的48度,但引物的Tm分别为57,71,阳性对照都没有出结果,请问是怎么回事呢?退火 引物退火温度是53度,如何设置两个梯度的退火温度 关于细菌基因组PCR的问题向做过细菌PCR的请教:体系一般都是多少,退火温度呢我们做过退火温度有48度、43度、56度,引物是通用引物1492R和27F,模板和引物都没问题,是不是引物和模板不匹配,10 引物退火温度差别十度以上怎么办? 求助巢式PCR退火温度的设定我最近准备做巢式PCR,下游引物用oligo dT,上游用两个基因特异性引物,但上游的两个引物和下游的oligo dT相比,Tm值差了将近10度,这样退火温度怎么设定呢? 做RT-PCR时,上下引物退火温度一定要一样吗?内参条带很亮,为什么没有目的基因? PCR扩增1829BP的片段,一对引物的Tm都是64度,退火温度已经试过55和50度都没有目的条带,请教pcr设置参数在55和50度只看到引物二聚体且有拖尾现象,没有目的条带 ISSR-PCR引物的退火温度问题我做ISSR-PCR引物的退火温度能不能直接使用primer5.0这个软件计算得出的退火温度.理论上来说这是最佳的退火温度吗? 我设计了引物,结果生物公司合成的引物退火温度比我设计的低10度,为什么,我用哪个退火温度 PCR过程中引物的碱基数量与种类 和 退火温度有什么关系?理由 PCR引物的发卡结构和二聚体可以通过提高退火温度克服吗 PCR引物的发卡结构和二聚体可以通过提高退火温度克服吗