怎么在NCBI上查酵母中的TPS/TPP基因序列

来源：学生作业帮助网编辑：作业帮时间：2024/04/29 18:04:30

怎么在NCBI上查酵母中的TPS/TPP基因序列
怎么在NCBI上查酵母中的TPS/TPP基因序列

怎么在NCBI上查酵母中的TPS/TPP基因序列
一般而言,在NCBI（也就是Entrez数据系统）查基因序列,主要是搜索的NCBI的Genbank数据库的核酸与蛋白质序列,方法见六零六406.由于Genbank起初是一个类似BBS的序列数据库系统,虽然目前有人工核对序列,但其数据库中的序列质量还是不如Swissprot数据库.最近,我们在投递序列过程中,其管理员与我们进行了很多的交流（基本上都是PhD）,所以他们肯定也开始注重数据质量了.但是,从数据规模上,NCBI还是比较全的,毕竟它有与EBI和DDBJ的数据每日交换机制.另外,NCBI提供的blast服务,也可以帮助你获得更多的同源序列.
因此,我建议首先从Swissprot上查询,下面以TPS为例：
1 搜索swissprot中的TPS基因
我们得到两个酵母相关基因,利用你的专业知识判断选择一个或两个.
2 点击进入P38426 (TPS3_YEAST),查看蛋白质序列是否你想要的.
3 进入NCBI的Blast服务页面,
在basic blast部分,你有两个选择：1）protein blast->搜索蛋白质序列；2）tblastN->搜索核酸序列.
4 进入程序搜索页面,将Swissprot的登录号P38426贴如输入框.
5 再下面就是如何使用Blast.
6 在Blast的结果中,你可以根据序列的相似性找你感兴趣的基因序列.
附图：一个blast的结果

怎么在NCBI上查酵母中的TPS/TPP基因序列 OMPA的基因序列是什么?怎么在NCBI上查? 怎么在NCBI上查基因的序列号等相关信息? 能教我怎么在NCBI上查蛋白质的一级结构吗? 怎么从NCBI上查某个基因序列? 怎么在NCBI上比对其他基因? 在NCBI上查一个基因的mRNA和蛋白质序列,怎么知道这个基因是含有信号肽的呢?哪个地方会说明? TPS(SUB）在汽车上是什么含义在NCBI上查到序列,如mRNA序列,确实存在吗?就是说,在NCBI上查到的序列是经过人验证,确实有这样的序列后在上传的吗?譬如说我查到了某个物种胸腺素的mRNA序列,但是没有发表在文章中的.这个序怎样从NCBI上查肌动蛋白的基因? 我想在ncbi上查某一生物肽的所有mRNA序列,该怎么查我是新手,查出来的东西好多都不是想要的.比如现在我想查LEAP-2的所有生物的mRNA序列,该怎么查.具体参数怎么输. 如何在NCBI上寻找要扩增的序列?我要用PRIMER 设计引物.位点是CYP2C19*2,是一个SNP的位点.我在NCBI里查到了这个基因的信息.现在我有3个问题如下：1.引物设计的对象是FASTA中的序列还是GENEBANK中的有没有知道怎么用NCBI查基因序列, ncbi怎么查乳酸菌的16s基因序列怎样在ncbi上查不同品种猪的同一基因的序列呢?就是线粒体基因co1， BT蛋白的基因名是什么啊?我要在NCBI上查他的基因序列~ NCBI上怎么用BLAST对比序列酵母中的质粒是否整合到酵母染色体上?怎么检测?怎么检测质粒是否整合到染色体上?